Lors de sa sortie en 2010 sur PlayStation®3, Yakuza 3 propulsait la série à un niveau encore jamais vu avec une refonte des mécaniques de combat et de splendides graphismes. Après avoir pris ses distances avec les yakuza, Kazuma Kiryu est parti gérer un orphelinat sur l'île paisible d'Okinawa. Hélas, quand le gouvernement et les yakuza se disputent la parcelle sur laquelle est situé l'orphelinat, Kiryu découvre qu'il doit consentir à des sacrifices pour défendre ce qui lui importe le plus.

Yakuza 3 marque la première apparition des « sites de jeu » : des lieux qui offrent une pause récréative bien méritée avec des mini-jeux comme le golf, l'entraînement de base-ball et le karaoke. C'était aussi la première apparition du système de « révélations » permettant d'apprendre de nouvelles techniques martiales, preuve que la série est aussi riche en humour et en émotions qu'en retournements de situation.